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Dès l’année 1639, en effet, le pape Urbain VIII revendique la juridiction des collèges d’Avignon et la remet à la Congrégation de la Propagande[1]. Quelques années plus tard, on introduit dans les deux plus importants de ces établissements, le collège du Roure et celui de Saint-Nicolas d’Annecy, les Pères de la Mission. En vain l’Université proteste et envoie une députation à Rome[2]. Pour achever l’œuvre commencée, on réunit, en 1709, ces deux collèges, devenus collèges pontificaux[3]. Le collège de la Croix avait été annexé, en 1704, au séminaire de Saint-Charles. Seul, celui de Saint-Michel, fondé par un ancien primicier de l’Université, conserve encore quelque indépendance administrative à l’égard de la Cour romaine.

Chose plus grave encore. Les collégiats désertent l’Université. En 1649, la Propagande veut les obliger à suivre les cours des Jésuites[4]. Déjà, elle leur avait imposé l’étude du droit canon et de la théologie, à l’exclusion du droit civil réservé aux seuls écoliers du Roure ; elle prétendait maintenant les obliger à entrer dans la vie ecclésiastique[5]. Ainsi les anciens collèges se transforment peu à peu en séminaires. Ils ne cessent cependant pas de fournir aux régents universitaires un certain nombre d’auditeurs : sans eux, remarque un primicier en 1729, les cours de théologie et de philosophie seraient déserts[6].

Au reste, pendant que ces changements se produisent, et

  1. Bulle d’Urbain VIII de juin 1639. M. C. 2445. Cf. A. V. D 29, fos 153 et 220.
  2. A. V. D 29, fo 236. Délib. du Collège des docteurs du 7 juill. 1645.
  3. Bulle pontificale de 1709.
  4. Délib. du Collège des docteurs, du 27 mai 1649. A. V. D 30, fo 8. Cf. A. V. D 32, fos 190, 202, 235, 248.
  5. Délib. du 7 juill. 1645. A. V. D 29, fo 236. En retour, les collégiats pouvaient étudier les lettres humaines et la philosophie, préparation nécessaire aux études théologiques.
  6. A. V. D 33, fo 46. Délib. du Collège des docteurs du 14 mai 1725.